Jacques Colinge

Das Team für Krebs-Bioinformatik und Systembiologie ist eine neu gegründete Arbeitsgruppe, die rechnergestützte Methoden zur Analyse großskaliger Datensätze und systembiologische Ansätze in der Krebsforschung einsetzt. Jacques Colinge interessiert sich insbesondere für die Anwendung von Konzepten der Netzwerkbiologie in diesem Kontext. Zu den zentralen Themen, die die Gruppe weiterentwickeln möchte, gehören:

• personalisierte Medizin
• Wirkmechanismen, Nebenwirkungen und Wiederverwendung von Krebsmedikamenten
• kombinierte Therapien
• Modellierung von Krebs-Signalwegen auf mehreren biologischen Skalen

Darüber hinaus beschäftigt sich die Gruppe mit der Entwicklung zentraler statistischer und mathematischer Modelle, die für moderne Technologien in der Krebsbiologie erforderlich sind. Dazu zählen unter anderem quantitative massenspektrometrische Verfahren zur Untersuchung posttranslationaler Modifikationen (z. B. Phosphorylierung, Histon-Acetylierung und -Methylierung) sowie Methoden zur Kartierung von Proteininteraktionen (z. B. Proteinkomplexe, Protein-Wirkstoff-Bindung, Protein-Nukleinsäure-Wechselwirkungen).

Jacques Colinge promovierte in Mathematik an der Universität Genf (Schweiz). Anschließend arbeitete er als Bioinformatiker am Serono Pharmaceutical Research Institute und baute später seine erste Forschungsgruppe bei GeneProt Inc. auf. Von 2006 bis 2014 leitete er die Bioinformatikgruppe am CeMM in Wien und war ab 2009 Adjunct Professor für Bioinformatik an der Technischen Universität Graz.

Seit November 2014 leitet Jacques Colinge eine Forschungsgruppe für Krebs-Bioinformatik und Systembiologie am Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM).

Dürnberger G, Bürckstümmer T, Huber K, Giambruno R, Doerks T, Karayel E, Burkard TR, Kaupe I, Müller AC, Schönegger A, Ecker GF, Lohninger H, Bork P, Bennett KL, Superti-Furga G, Colinge J. Experimental characterization of the human non-sequence-specific nucleic acid interactome. Genome Biol. 2013 Jul 31;14(7):R81. (abstract)

Pichlmair A, Kandasamy K, Alvisi G, Mulhern O, Sacco R, Habjan M, Binder M, Stefanovic A, Eberle CA, Goncalves A, Bürckstümmer T, Müller AC, Fauster A, Holze C, Lindsten K, Goodbourn S, Kochs G, Weber F, Bartenschlager R, Bowie AG, Bennett KL, Colinge J, Superti-Furga G. Viral immune modulators perturb the human molecular network by common and unique strategies. Nature. 2012 Jul 26;487(7408):486-90. (abstract)

Stukalov A, Superti-Furga G, Colinge J. Deconvolution of targeted protein-protein interaction maps. J Proteome Res. 2012 Aug 3;11(8):4102-9. (abstract)

Breitwieser FP, Müller A, Dayon L, Köcher T, Hainard A, Pichler P, Schmidt-Erfurth U, Superti-Furga G, Sanchez JC, Mechtler K, Bennett KL, Colinge J. General statistical modeling of data from protein relative expression isobaric tags. J Proteome Res. 2011 Jun 3;10(6):2758-66. (abstract)