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Mutational Dynamics of SARS-CoV-2 in Austria

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RNA sample preparation and genome sequencing at CeMM / © CeMM

As a leading biomedical research institute, CeMM, the Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences, is committed to advancing our molecular understanding of the COVID-19 pandemic and the causative pathogen, SARS-CoV-2. Biomedical research on the virus and the disease will contribute substantially to informed policy decisions and, ultimately, the development of new treatments.

An interdisciplinary team at CeMM under the project leadership of virologist Andreas Bergthaler and computational biologist Christoph Bock will investigate SARS-CoV-2 genome evolution in patients by deep sequencing and sophisticated computational analyses. This will result in rapid open sharing of SARS-CoV-2 genomes from Austria, inform epidemiologists to reconstruct transmission chains, and offer invaluable insights into the molecular dynamics of the ravaging viral pandemic.

The work is part of a collaboration network with Elisabeth Puchhammer-Stöckl from the Center for Virology of the Medical University of Vienna as primary partner. The network is open to additional collaborations and especially welcomes contributions from clinical virologists and diagnostics laboratories across Austria. First collaborations with evolution biologists, population geneticists and virologists have already started. Integration of Austria’s contribution into an emerging world-wide map of SARS-CoV-2 mutations will help decipher the mutational dynamics underlying the pandemic.

CeMM is focusing efforts to soon openly share the first SARS-CoV-2 genomes from Austria with the world. We encourage the scientific community and industry to use these results to accelerate research to fight the coronavirus, and hope the data will support policy makers and epidemiologists to better understand how the virus is spreading”, says Giulio Superti-Furga, CeMM Director.

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Mutationsdynamik von SARS-CoV-2 in Österreich

Als führendes biomedizinisches Forschungsinstitut engagiert sich CeMM, das Forschungszentrum für Molekulare Medizin der Österreichischen Akademie der Wissenschaften, für das bessere molekulare Verständnis der COVID-19-Pandemie und des Erregers SARS-CoV-2. Die biomedizinische Erforschung des Virus wird wesentlich zu fundierten politischen Entscheidungen und letztendlich zur Entwicklung neuer Therapien beitragen.

Ein interdisziplinäres Team am CeMM unter der Projektleitung von Andreas Bergthaler, Virologe, und Christoph Bock, Bioinformatiker, wird die SARS-CoV-2-Genomentwicklung bei Patienten mittels ausgereifter Sequenzier- und Analysemethoden untersuchen. Dies wird zu einer raschen, frei zugänglichen Veröffentlichung von SARS-CoV-2-Genomen aus Österreich führen, Epidemiologen bei der Rekonstruktion von Übertragungsketten unterstützen und wertvolle Einblicke in die molekulare Dynamik der verheerenden Viruspandemie liefern.

Die Forschungsarbeit am CeMM ist Teil eines Netzwerks, und Elisabeth Puchhammer-Stöckl vom Zentrum für Virologie der Medizinischen Universität Wien eine essentielle Kooperationspartnerin. Das Netzwerk ist offen für weitere Kooperationen und begrüßt insbesondere Beiträge von klinischen Virologen und Diagnostiklabors aus ganz Österreich. Erste Kooperationen mit Evolutionsbiologen, Populationsgenetikern und Virologen haben bereits begonnen. Der österreichische Beitrag zu einer weltweiten Karte von SARS-CoV-2-Mutationen ist ein wichtiger Schritt, die Mutationsdynamik der Pandemie zu entschlüsseln.

CeMM fokussiert sich darauf, die ersten SARS-CoV-2-Genome aus Österreich bald offen mit der Welt zu teilen. Wir ermutigen die Wissenschaft und Industrie, diese Ergebnisse zu nutzen, um die Forschung zur Bekämpfung des Coronavirus zu beschleunigen. Wir hoffen, dass die Daten politische Entscheidungsträger und Epidemiologen dabei unterstützen, die Ausbreitung des Virus besser zu verstehen“, sagt Giulio Superti-Furga, CeMM-Direktor.