Viral genome sequencing helps understanding the mutational behaviour and transmission of the virus (© Bobby Rajesh Malhotra / CeMM).

 

The sequences and related information can be openly accessed at:
Die Sequenzierungsdaten sind unter dem folgenden Link verfügbar:

•    Nextstrain - Real-time tracking of pathogen evolution

Additional information can be found at:
Weitere Informationen finden Sie unter:

•    SARS-CoV-2 Austria project website

 

SARS-CoV-2 Publications

Agerer B*, Koblischke M*, Gudipati V*, Montaño-Gutierrez LF, Smyth S, Popa A, Genger J-W, Endler L, Florian DM, Mühlgrabner V, Graninger M, Aberle SW, Husa A-M, Shaw LE, Lercher A, Gattinger P, Torralba-Gombau R, Trapin D, Penz T, Barreca D, Fae I, Wenda S, Traungott M, Walder G, Pickl WF, Thiel V, Allerberger F, Stockinger H, Puchhammer-Stöckl E, Weninger W, Fischer G, Hoepler W, Pawelka E, Zoufaly A, Valenta R, Bock C, Paster W, Geyeregger R, Farlik M, Halbritter F, Huppa JB**, Aberle JH**, Bergthaler A**. SARS-CoV-2 mutations in MHC-I restricted epitopes evade CD8+ T cell responses. Sci Immunol. 2021 Mar 4;6(57):eabg6461. DOI: 10.1126/sciimmunol.eabg6461

*, **Equal contributions

Popa A, Genger J-W, Nicholson MD, Penz T, Schmid D, Aberle SW, Agerer B, Lercher A, Endler L, Colaço H, Smyth M, Schuster M, Grau ML, Martínez-Jiménez F, Pich O, Borena W, Pawelka E, Keszei Z, Senekowitsch M, Laine J, Aberle JH, Redlberger-Fritz M, Karolyi M, Zoufaly A, Maritschnik S, Borkovec M, Hufnagl P, Nairz M, Weiss G, Wolfinger MT, von Laer D, Superti-Furga G, Lopez-Bigas N, Puchhammer-Stöckl E, Allerberger F, Michor F, Bock C, Bergthaler A. Genomic epidemiology of superspreading events in Austria reveals mutational dynamics and transmission properties of SARS-CoV-2. Sci Transl Med. 2020 Dec 9;12(573):eabe2555. DOI: 10.1126/scitranslmed.abe2555. Epub 2020 Nov 23.

 

 

1100 SARS-CoV-2 genomes in Austria openly available

Page updated on 6 May 2021

An interdisciplinary team led by CeMM Principal Investigators Andreas Bergthaler and Christoph Bock have since March 2020 obtained more than 1100 samples from Austria, of which 747 resulted in full-length high-quality SARS-CoV-2 genomes.

Researchers at CeMM in collaboration with the Austrian Agency for Health and Food Safety (AGES), are now looking for specific SARS-CoV-2 variants with multiple spike protein mutations by sequencing additional virus samples in Austria.

In March 2021, Andreas Bergthaler received the SARS-CoV-2 urgent funding from the Austrian Science Fund (FWF) to further expand his corona research.

CeMM is proud to be able to provide this important analysis of SARS-CoV-2 sequences for Austria and the international scientific community as quickly as possible, commensurate to the available means. CeMM, however, abstains from any speculative interpretation on the data it produces or from suggestions on policy measures.

___

 

1100 SARS-CoV-2-Genome aus Österreich veröffentlicht

Aktualisiert am 6 Mai 2021

Das interdisziplinäre Team um Andreas Bergthaler und Christoph Bock vom CeMM hat mehr als 1100 Virus-Proben aus Österreich sequenziert, von denen 747 zu hochwertigen SARS-CoV-2-Genomen in voller Länge führten.

Das Team am CeMM sucht nun in Zusammenarbeit mit der Österreichischen Agentur für Ernährungssicherheit (AGES) nach spezifischen SARS-CoV-2-Varianten mit mehreren Spike-Protein-Mutationen, indem zusätzliche Virusproben in Österreich sequenziert werden.

Im März 2021 erhielt Andreas Bergthaler die SARS-CoV-2-Akutförderung des Wissenschaftsfonds FWF, um seine Corona-Forschung weiter auszubauen.

CeMM ist stolz darauf, diese wichtige Analyse der SARS-CoV-2-Sequenzen für Österreich und für die internationale Wissenschaftsgemeinschaft mit den gegebenen Mitteln bereitstellen zu können. CeMM verzichtet auf spekulative Interpretationen der Daten oder auf die Anregung politischer Maßnahmen.

Zum vollständigen Newstext.