The sequences and related information can be openly accessed at:
Die Sequenzierungsdaten sind unter den folgenden Links verfügbar:

•    GISAID - Global Initiative on Sharing All Influenza Data
•    Nextstrain - Real-time tracking of pathogen evolution

 

216 SARS-CoV-2 genomes in Austria openly available

The molecular sequence analysis revealed on average 6.9 mutations per viral genome, of which more than 4 resulted in changed amino acids. A particular focus of interest worldwide rests on mutations in the viral S or spike protein, which decorates the surface of the virion and lends the coronavirus its eponymous crown-like appearance (see illustration 2). This viral S protein is essential for binding to the cellular receptor ACE2 as well as the presumed primary target for neutralizing antibodies. As such, mutations in this region will be important for the development of serological tests and antibody-mediated protection by vaccines. Within all Austrian SARS-CoV-2 genomes, we identified a total number of 12 mutated residues in the 1,273 amino acid long S protein. One particular mutation in the S protein, D614G, represents an early branching point that is dominant in the European infection clusters and parts of North America (see illustrations 2 and 3). This mutation is also found in many of the Austrian samples. The potential functional consequences of the D614G mutation are currently being investigated by several international laboratories. CeMM’s ongoing in-depth viral mutation analyses with an interdisciplinary team from the fields of genomics, biomathematical modeling, evolution biology and virology will yield new insights into how the S protein and other viral proteins evolve as well as how these mutations are transmitted between individuals.

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216 SARS-CoV-2-Genome aus Österreich veröffentlicht

Die molekulare Sequenzanalyse ergab durchschnittlich 6,9 Mutationen pro Genom, von denen mehr als 4 zu veränderten Aminosäuren führten. Weltweit besonders im Fokus des Interesses stehen die Mutationen im viralen S- oder Spike-Protein, welcher die Oberfläche des Virions ziert und dem Coronavirus das namensgebende, kronenartige Aussehen verleiht (s. Abbildung 2). Das virale S-Protein ist für die Anbindung an den Zellrezeptor ACE2 essenziell und auch das primäre Ziel für neutralisierende Antikörper. Als solches sind Mutationen in dieser Region für die Entwicklung serologischer Tests und den antikörperbedingten Schutz durch Schutzimpfungen wichtig. In allen österreichischen SARS-CoV-2-Genomen haben wir insgesamt 12 mutierte Veränderungen im 1.273 Aminosäuren langen S-Protein identifiziert. Darunter befindet sich die Virusmutation D614G, welche eine frühe Gabelung der Transmissionskette von SARS-CoV-2 in Europa darstellt (s. Abbildungen 2 und 3). D614G findet sich auch in der Mehrzahl der Virusgenome aus Österreich. Die funktionellen Konsequenzen der D614G Mutation werden gegenwärtig von mehreren internationalen Forschungsgruppen untersucht.

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